Nach seinem Studium an der Universität Paris I und in Sciences Po Paris begann Emmanuel Meillan seine berufliche Laufbahn 2004 in einer Managementposition bei der préfecture de police in Paris. Anschließend spezialisierte er sich auf europäische Fragen, indem er den Master of European Governance and Administration (École nationale d'administration/Universität Potsdam) absolvierte und 2007 Erfahrung im deutschen Bundesministerium des Innern in Berlin sammelte. Er war im französischen Innenministerium an der Steuerung der französischen EU-Ratspräsidentschaft 2008 beteiligt und wechselte dann in die Abteilung für internationale und europäische Angelegenheiten des Ministeriums. Von 2011 bis 2021 arbeitete er an der Umsetzung der staatlichen Politik auf lokaler Ebene als Generalsekretär der sous-préfecture in Molsheim (Elsass) und anschließend als Leiter des Referats für politische Angelegenheiten in der préfecture in Straßburg. Seit Mai 2022 ist er an der Universität Wien tätig, um das MEDem-Projekt am Institut für Publizistik- und Kommunikationswissenschaft zu koordinieren.